Når cigaretrøg føres gennem et filter, efterlader det et sort, klistret stof kendt som tjære. Den nøjagtige sammensætning af den tjære, som rygere indånder, er usikker. Enhver form for plantemateriale er en ægte heksebryg af komplekse kemiske forbindelser. Forbrænding transformerer disse forbindelser i tobaksblade på en uforudsigelig måde, og den endelige sammensætning af den inhalerede røg afhænger nøjagtigt af, hvordan en cigaret ryges. Selvom det er svært at bestemme nøjagtigt, hvad der er i tjære, er det klart, at det forårsager de fleste af de skadelige sundhedsmæssige virkninger af tobak.
Lungekræft
Lungekræft er en af de mest kendte sygdomme forårsaget af rygning. Nogle kendte kræftfremkaldende stoffer, der normalt findes i tjære, inkluderer benzen, acrylamid og acrylonitril. Rygning udsætter de delikate celler inde i lungerne direkte for disse forbindelser, hvilket forårsager mutationer i cellenes DNA og fører til kræft. I henhold til Verdenssundhedsorganisationens rapport om "Tobaksrøg og ufrivillig rygning" kan 90 procent af alle tilfælde af lungekræft henføres til rygning.
Emfysem
Emfysem er en sygdom, hvor den komplekse honningkom af luftpassager og lommer inde i lungerne bryder sammen, hvilket fører til store åbne luftrum. Disse store rum absorberer ikke ilt fra luften næsten såvel som det originale lungevæv, hvilket fører til åndenød. Det er også sværere at skubbe luft ud af det beskadigede lungevæv, hvilket fører til øget indsats for udånding. Forbindelser i tjære forårsager betændelse inde i lungerne, som aktiverer immunsystemets celler. Over tid medfører den konstante aktivitet af disse immunceller nedbrud af lungevæv og emfysem.
Hjerte sygdom
Rygere har en langt højere frekvens af hjertesygdomme, CAD, end ikke-ryger. En del af denne øgede risiko skyldes nikotinet i cigaretter, men tjære spiller også en betydelig rolle. Nogle af forbindelserne i tjære adsorberes gennem lungerne og kommer ind i blodomløbet. Når de først er der, fremmer de en kemisk transformation af kolesterolet i blodet, der gør det meget mere sandsynligt, at der dannes plaques på væggene i arterierne, inklusive koronararterierne. Rygning og højt kolesteroltal er derfor multiplikative risikofaktorer for CAD. At have begge sammen er meget værre end summen af at have dem hver for sig.